方法一：
一个中心:停止服务,载入安全模式
killall -TERM mysqld
然后
mysqld --skip-grant-tables &
两个基本点：更新user表，刷新权限
use mysql;
update user set password=password("newpass") where user="root";
flush privileges;
如果不方便用mysql的cli界面交互
调用mysqladmin即可
mysqladmin -u root flush-privileges password "newpassword"
方法二（debian亲测）：
直接使用/etc/mysql/debian.cnf文件中[client]节提供的用户名和密码 备用
mysql -u debian-sys-maint -p
Enter password: <输入[client]节的密码>
mysql> show databases;
mysql> use mysql;
mysql> show tables;
这个时候使用user表
mysql> UPDATE user SET Password=PASSWORD(‘newpassword’) where USER=’root’;
Query OK, 3 rows affected (0.00 sec)
Rows matched: 3 Changed: 3 Warnings: 0
mysql> FLUSH PRIVILEGES;
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)
mysql> quit
# mysql -u root -p
Enter password: <输入新设的密码newpassword>
mysql>
方法三(centos 6.2亲测，等同于方法一)：
1．确认服务器处于安全的状态，在重新设置MySQL的root密码的期间，MySQL数据库完全出于没有密码保护，不连网操作最好，实在不行挑个好时候，操作要快
2．修改MySQL的登录设置：
# vi /etc/my.cnf
在[mysqld]的段中加上一句：skip-grant-tables
例如：
[mysqld]
datadir=/var/lib/mysql
socket=/var/lib/mysql/mysql.sock
skip-grant-tables
保存并且退出vi。
3．重新启动mysqld
# /etc/init.d/mysqld restart
Stopping MySQL: [ OK ]
Starting MySQL: [ OK ]
4．登录并修改MySQL的root密码
[root@vps ~]# mysql
Welcome to the MySQL monitor. Commands end with ; or \g.
Your MySQL connection id is 2
Server version: 5.1.61 Source distribution
Copyright (c) 2000, 2011, Oracle and/or its affiliates. All rights reserved.
Oracle is a registered trademark of Oracle Corporation and/or its
affiliates. Other names may be trademarks of their respective
owners.
Type 'help;' or '\h' for help. Type '\c' to clear the current input statement.
mysql> use mysql;
Reading table information for completion of table and column names
You can turn off this feature to get a quicker startup with -A
Database changed
mysql> update user set password=password('jpuyy') where user = 'root';
Query OK, 2 rows affected (0.00 sec)
Rows matched: 2 Changed: 2 Warnings: 0
mysql> flush privileges;
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)
mysql> quit
Bye
5．将MySQL的登录设置修改回来
# vi /etc/my.cnf
将刚才在[mysqld]的段中加上的skip-grant-tables删除
保存并且退出vi。
6．重新启动mysqld
# /etc/init.d/mysqld restart
Stopping MySQL: [ OK ]
Starting MySQL: [ OK ]
附加windows下的重置方法
开始-运行-cmd
net stop mysql
然后进入到mysql的安装位置，运行如下命令
mysqld-nt.exe –skip-grant-tables
再打开一个cmd窗口
运行msyql -u root -p，不用输入密码即可进入
> use mysql
> UPDATE user SET Password=PASSWORD(‘newpassword’) where USER=’root’;
>flush privileges;
最后在任务管理器里将mysql-nt的任务和进程都停止掉（如果不停掉会出现“mysql服务无法启动。系统出错。系统发生1067错误。进程意外中止。”），接下来
net start mysql
密码重置完成。